Q. 申請書をコピーする時、特定の項目はコピーしないよう設定することはできますか？

A. できます。

経路設定の申請書類アイコンをクリックし、段階設定タブにて、特定の項目の「再利用初期化」をONにすると、
申請書の再利用申請をおこなう際に、特定の項目はコピーされず、初期化されます。